Desenvolvimento e automação de metolodogias in silico para o estudo de complexos de inclusão utilizados na inova o terapêutica

Abstract

Este trabalho apresenta uma metodologia in silico para o estudo de complexos de inclus o utilizados na inova o terap utica. Um complexo de inclus o formado por um host (hospedeiro), e por um guest (h spede). Neste trabalho, o host estudado a ciclodextrina (e seus derivados) e o guest, um ligante (f rmaco, em potencial), formando o complexo host:guest. O objetivo desse projeto desenvolver uma plataforma (CycloMolder) capaz de realizar estudos in silico dos complexos de inclus o de forma autom tica e precisa, fazendo uso de uma interface gr fica de usu rio. Esse objetivo foi tra ado para facilitar os estudos de modelagem molecular para este tipo de sistema qu mico, com interesse farmac utico. A plataforma composta por dois m dulos: CycloGen e CycloDock. O primeiro m dulo (CycloGen) constr i modelos com mais de uma estrutura para representar um derivado de ciclodextrina. O segundo m dulo (CycloDock) realiza o c lculo de docking molecular entre as mol culas host e guest, utilizando o programa Autodock Vina e apresenta os resultados obtidos, incluindo gr ficos que mostram a distribui o energ tica e as intera es intermoleculares do complexo. O programa CycloMolder foi testado atrav s de estudos de casos inspirados em problemas farmac uticos reais. Os testes realizados destacaram a import ncia da gera o de mais de uma configura o para representar significativamente um derivado de ciclodextrina, e tamb m mostrou o potencial anal tico do programa, proporcionado pela automa o do estudo de modelagem, execu o dos c lculos e an lise dos resultados. De forma geral, o programa CycloMolder atinge seus objetivos, automatizando e simplificando os estudos in silico dos complexos de inclus o, contribuindo desta forma para a inova o terap utica.