Análise comparativa de transposons classe II (CACTA e Mutator) nos genomas de Vigna unguiculada, Phaseolus vulgaris e Medicago truncatula

Abstract

Os elementos transponíveis (TEs) são sequências móveis de DNA, presentes em quase todos os organismos já estudados. Constituem parte abundante dos genomas, influenciando em sua estrutura e atividade de diversas maneiras. Dessa forma, conhecer a composição e a distribuição de TEs em leguminosas como Vigna unguiculata, Phaseolus vulgaris e Medicago truncatula é parte importante do conhecimento da influência destes nos genomas vegetais. Usando ferramentas bioinformáticas baseadas em homologia, esse trabalho identificou um total de 5,64 Mb de transposons e 48,42 Mb de retrotransposons, distribuídos em todos os cromossomos de P. vulgaris; 14,04 Mb de transposons e 51,20 de retrotransposons em M. truncatula, e 2,38 Mb e 9,34 Mb de transposons e retrotransposons, respectivamente, em V. unguiculata. Todos apresentaram CACTA e Mutator entre as três superfamílias de transposons mais abundantes no genoma. Além disso, a identificação de transcritos em cultivares contrastantes quanto à tolerância à seca em V. unguiculata mostrou que a cultivar tolerante apresentou maior número de transcritos de CACTA e Mutator que a cultivar susceptível. Interessantemente apesar de possuir o menor genoma, M. truncatula foi a leguminosa com maior quantidade de TEs, possivelmente por sua maior tolerância à atividade destes elementos ou menor controle epigenético. Por outro lado, a despeito dos riscos inerentes à sua atividade, a maior abundância de transcritos na cultivar tolerante à seca de V. unguiculata indica que a atividade dos TEs pode conferir uma vantagem evolutiva.