Caracterização de sequências repetitivas em Phaseolus L. grupo Leptostachyus (Fabaceae) : um clado de rápida evolução cariotípica

Abstract

Sequências repetitivas são responsáveis por grandes diferenças entre os genomas, pois variam mais rapidamente que sequências únicas. Além disso, eventos de recombinação entre sequências repetitivas similares podem levar a rearranjos cromossômicos. No gênero Phaseolus, o grupo Leptostachyus, com três espécies incluindo P. leptostachyus e P. macvaughii, apresenta cariótipo disploide devido a uma inserção cêntrica, além de várias translocações. O objetivo do trabalho foi investigar a fração de DNA repetitivo dessas duas espécies e analisar sua possível relação com a ocorrência de rearranjos. Para isso, suas sequências repetitivas foram comparadas com as de outras 11 espécies, três delas cariotipicamente estáveis. As sequências foram agrupadas por similaridade no RepeatExplorer e a ferramenta Tarean foi usada para identificação de DNAs satélites. As principais sequências foram localizadas in situ. Os elementos Ty3/gypsy, mais especificamente a linhagem Chromovirus, foram os mais abundantes em Phaseolus e tiveram uma distribuição cromossômica preferencialmente pericentromérica. A variação na abundância das principais linhagens de elementos transponíveis entre espécies de Leptostachyus foi similar à variação entre as mesmas e as demais espécies do gênero, sugerindo rápido turnover no grupo. Os DNAs satélites compartilhados revelaram padrões de distribuição cromossômica diferentes entre as espécies, confirmando sua rápida evolução no genoma. A distribuição atípica de um dos satélites se mostrou compatível com uma possível associação desse com os rearranjos cromossômicos frequentes no grupo.