Variabilidade da Fração Repetitiva de DNA de Passiflora foetida L. (Passifloraceae)

Abstract

O gênero Passiflora L. compreende cerca de 500 espécies, com maior diversidade nas regiões neotrópicas, principalmente no subgênero Passiflora, com ~250 espécies. Passiflora foetida L. foi a primeira linhagem a divergir dentro desse subgênero e apresenta número cromossômico haploide n = 10, diferindo das demais, que possuem n = 9. Dentro das espécies do subgenero, há uma abundância da fração repetitiva que é compatível ao aumento de tamanho de seus genomas. Para as espécies da seção Dysosmia, onde P. foetida está inserida, não há estudos detalhados sobre a fração repetitiva. Além disso, dentro dessa espécie, há um complexo de variedades pouco compreendido, com ampla distribuição geográfica, caracterizado principalmente por diferenças morfológicas. O objetivo deste trabalho foi caracterizar detalhadamente a fração repetitiva do genoma de P. foetida, e analisar de forma comparativa a organização dos repeats em relação as demais espécies do subgênero caracterizadas em estudos anteriores. Com o intuito de investigar a existência de variação intraespecifica na fração repetitiva de P. foetida, também analisamos comparivamente variedades. Os resultados demonstraram que P. foetida possui uma proporção de fração repetitiva condizente com o tamanho de seu genoma 1C= 440,1 Mpb, porém com uma acentuada variação intraespecífica. Os retroelementos do tipo Ty1/copia foram os mais abundantes, assim como nas outras espécies do subgênero, porém os do tipo Ty3/gypsy representaram uma fração muito menor em relação às demais. Também foi observada similaridade com DNAs satélites de diferentes subgêneros, corroborando sua posição filogenética ancestral. As análises entre suas variedades evidenciaram grande plasticidade na composição genômica, menor que entre as espécies já descritas da seção Dysosmia. Além disso, novos satélites espécie-específicos foram descritos, principalmente compondo a sua região centromérica, destacando-se a identificação do primeiro satélite centromérico do gênero evidenciando eventos recentes no grupo.